Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC3.75□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC3.74□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
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