Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC2.62□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC2.62□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
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TRAF3Q13114 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
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TRAF3Q13114 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC2.61□□□□□ -1.99
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TRAF3Q13114 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
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TRAF3Q13114 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
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TRAF3Q13114 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
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TRAF3Q13114 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
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TRAF3Q13114 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
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TRAF3Q13114 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
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TRAF3Q13114 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TRAF3Q13114 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
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