Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
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