Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
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