Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
GRIN2AQ12879 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
GRIN2AQ12879 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
GRIN2AQ12879 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
GRIN2AQ12879 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
GRIN2AQ12879 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC0.18□□□□□ -2.38
GRIN2AQ12879 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
GRIN2AQ12879 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
GRIN2AQ12879 AC008632.1-202ENST00000518605 452 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
GRIN2AQ12879 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
GRIN2AQ12879 AC098483.2-201ENST00000603158 454 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
GRIN2AQ12879 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
GRIN2AQ12879 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
GRIN2AQ12879 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
GRIN2AQ12879 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
GRIN2AQ12879 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
GRIN2AQ12879 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
GRIN2AQ12879 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
GRIN2AQ12879 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
GRIN2AQ12879 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC0.17□□□□□ -2.38
GRIN2AQ12879 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
GRIN2AQ12879 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
GRIN2AQ12879 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
GRIN2AQ12879 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
GRIN2AQ12879 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
GRIN2AQ12879 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
GRIN2AQ12879 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
GRIN2AQ12879 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
GRIN2AQ12879 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
GRIN2AQ12879 AL590623.1-201ENST00000427864 105 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
GRIN2AQ12879 MTND4LP14-201ENST00000429447 288 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
GRIN2AQ12879 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
GRIN2AQ12879 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
GRIN2AQ12879 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC0.16□□□□□ -2.38
GRIN2AQ12879 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
GRIN2AQ12879 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
GRIN2AQ12879 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
GRIN2AQ12879 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
GRIN2AQ12879 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
GRIN2AQ12879 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
GRIN2AQ12879 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
GRIN2AQ12879 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
GRIN2AQ12879 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
GRIN2AQ12879 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
GRIN2AQ12879 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
GRIN2AQ12879 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
GRIN2AQ12879 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
GRIN2AQ12879 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
GRIN2AQ12879 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
GRIN2AQ12879 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
GRIN2AQ12879 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
GRIN2AQ12879 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
GRIN2AQ12879 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.15□□□□□ -2.39
GRIN2AQ12879 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC0.15□□□□□ -2.39
GRIN2AQ12879 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
GRIN2AQ12879 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
GRIN2AQ12879 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
GRIN2AQ12879 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
GRIN2AQ12879 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
GRIN2AQ12879 AC013262.1-201ENST00000426710 252 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
GRIN2AQ12879 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
GRIN2AQ12879 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
GRIN2AQ12879 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC0.15□□□□□ -2.39
GRIN2AQ12879 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
GRIN2AQ12879 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
GRIN2AQ12879 AC253576.2-201ENST00000618815 580 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
GRIN2AQ12879 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.14□□□□□ -2.39
GRIN2AQ12879 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
GRIN2AQ12879 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
GRIN2AQ12879 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
GRIN2AQ12879 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
GRIN2AQ12879 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
GRIN2AQ12879 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
GRIN2AQ12879 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
GRIN2AQ12879 AL365273.2-201ENST00000491114 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.13□□□□□ -2.39
GRIN2AQ12879 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
GRIN2AQ12879 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
GRIN2AQ12879 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
GRIN2AQ12879 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
GRIN2AQ12879 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
GRIN2AQ12879 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC0.12□□□□□ -2.39
GRIN2AQ12879 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
GRIN2AQ12879 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
GRIN2AQ12879 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.12□□□□□ -2.39
GRIN2AQ12879 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
GRIN2AQ12879 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
GRIN2AQ12879 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
GRIN2AQ12879 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
GRIN2AQ12879 RNFT1P2-201ENST00000443064 757 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
GRIN2AQ12879 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
GRIN2AQ12879 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC0.12□□□□□ -2.39
GRIN2AQ12879 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
GRIN2AQ12879 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
GRIN2AQ12879 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
GRIN2AQ12879 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
GRIN2AQ12879 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
GRIN2AQ12879 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
GRIN2AQ12879 SNORD114-31-201ENST00000363219 75 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
GRIN2AQ12879 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
GRIN2AQ12879 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.8 ms