Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.2 ms