Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXA13P31271 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXA13P31271 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXA13P31271 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXA13P31271 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXA13P31271 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXA13P31271 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXA13P31271 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXA13P31271 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXA13P31271 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXA13P31271 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXA13P31271 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXA13P31271 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXA13P31271 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXA13P31271 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXA13P31271 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXA13P31271 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXA13P31271 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXA13P31271 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXA13P31271 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXA13P31271 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXA13P31271 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXA13P31271 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXA13P31271 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXA13P31271 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXA13P31271 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
HOXA13P31271 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXA13P31271 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXA13P31271 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
HOXA13P31271 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXA13P31271 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXA13P31271 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXA13P31271 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXA13P31271 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
HOXA13P31271 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
HOXA13P31271 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
HOXA13P31271 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXA13P31271 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXA13P31271 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
HOXA13P31271 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXA13P31271 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXA13P31271 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
HOXA13P31271 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXA13P31271 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXA13P31271 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXA13P31271 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
HOXA13P31271 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXA13P31271 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXA13P31271 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
HOXA13P31271 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXA13P31271 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXA13P31271 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXA13P31271 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
HOXA13P31271 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
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HOXA13P31271 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HOXA13P31271 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HOXA13P31271 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HOXA13P31271 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HOXA13P31271 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HOXA13P31271 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HOXA13P31271 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HOXA13P31271 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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HOXA13P31271 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HOXA13P31271 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
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HOXA13P31271 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HOXA13P31271 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
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HOXA13P31271 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HOXA13P31271 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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HOXA13P31271 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
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HOXA13P31271 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
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HOXA13P31271 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HOXA13P31271 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HOXA13P31271 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HOXA13P31271 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HOXA13P31271 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HOXA13P31271 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HOXA13P31271 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
HOXA13P31271 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HOXA13P31271 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HOXA13P31271 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HOXA13P31271 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HOXA13P31271 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
HOXA13P31271 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
HOXA13P31271 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HOXA13P31271 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HOXA13P31271 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
HOXA13P31271 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HOXA13P31271 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HOXA13P31271 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HOXA13P31271 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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