Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ERVV-2B6SEH9 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ERVV-2B6SEH9 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ERVV-2B6SEH9 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ERVV-2B6SEH9 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ERVV-2B6SEH9 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ERVV-2B6SEH9 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ERVV-2B6SEH9 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ERVV-2B6SEH9 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ERVV-2B6SEH9 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ERVV-2B6SEH9 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ERVV-2B6SEH9 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ERVV-2B6SEH9 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
ERVV-2B6SEH9 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ERVV-2B6SEH9 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ERVV-2B6SEH9 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ERVV-2B6SEH9 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ERVV-2B6SEH9 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ERVV-2B6SEH9 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ERVV-2B6SEH9 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ERVV-2B6SEH9 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ERVV-2B6SEH9 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ERVV-2B6SEH9 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ERVV-2B6SEH9 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ERVV-2B6SEH9 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ERVV-2B6SEH9 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ERVV-2B6SEH9 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVV-2B6SEH9 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVV-2B6SEH9 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVV-2B6SEH9 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVV-2B6SEH9 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVV-2B6SEH9 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVV-2B6SEH9 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVV-2B6SEH9 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVV-2B6SEH9 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVV-2B6SEH9 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVV-2B6SEH9 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVV-2B6SEH9 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVV-2B6SEH9 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVV-2B6SEH9 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVV-2B6SEH9 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVV-2B6SEH9 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVV-2B6SEH9 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVV-2B6SEH9 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVV-2B6SEH9 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVV-2B6SEH9 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVV-2B6SEH9 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVV-2B6SEH9 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVV-2B6SEH9 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVV-2B6SEH9 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVV-2B6SEH9 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVV-2B6SEH9 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVV-2B6SEH9 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVV-2B6SEH9 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVV-2B6SEH9 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVV-2B6SEH9 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVV-2B6SEH9 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVV-2B6SEH9 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVV-2B6SEH9 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVV-2B6SEH9 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVV-2B6SEH9 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVV-2B6SEH9 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVV-2B6SEH9 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVV-2B6SEH9 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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ERVV-2B6SEH9 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVV-2B6SEH9 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVV-2B6SEH9 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVV-2B6SEH9 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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ERVV-2B6SEH9 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVV-2B6SEH9 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVV-2B6SEH9 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVV-2B6SEH9 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVV-2B6SEH9 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVV-2B6SEH9 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVV-2B6SEH9 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVV-2B6SEH9 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVV-2B6SEH9 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVV-2B6SEH9 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
ERVV-2B6SEH9 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ERVV-2B6SEH9 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
ERVV-2B6SEH9 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
ERVV-2B6SEH9 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ERVV-2B6SEH9 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ERVV-2B6SEH9 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ERVV-2B6SEH9 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ERVV-2B6SEH9 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ERVV-2B6SEH9 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ERVV-2B6SEH9 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ERVV-2B6SEH9 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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