Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
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USP18Q9UMW8 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
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USP18Q9UMW8 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
USP18Q9UMW8 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
USP18Q9UMW8 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
USP18Q9UMW8 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
USP18Q9UMW8 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
USP18Q9UMW8 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
USP18Q9UMW8 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
USP18Q9UMW8 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
USP18Q9UMW8 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
USP18Q9UMW8 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
USP18Q9UMW8 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
USP18Q9UMW8 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
USP18Q9UMW8 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
USP18Q9UMW8 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
USP18Q9UMW8 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
USP18Q9UMW8 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
USP18Q9UMW8 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
USP18Q9UMW8 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
USP18Q9UMW8 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
USP18Q9UMW8 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
USP18Q9UMW8 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
USP18Q9UMW8 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
USP18Q9UMW8 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
USP18Q9UMW8 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
USP18Q9UMW8 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
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