Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.2□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
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HOXD1Q9GZZ0 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
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HOXD1Q9GZZ0 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
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HOXD1Q9GZZ0 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
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HOXD1Q9GZZ0 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
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HOXD1Q9GZZ0 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
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