Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN7

TRERF1, Transcriptional-regulating factor 1, humanhuman

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Length 1,200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRERF1Q96PN7 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 AC084398.2-201ENST00000551918 564 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 PRLR-217ENST00000618457 11688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 AC079070.1-201ENST00000578740 555 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TRERF1Q96PN7 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
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