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| TMX3 | Q96JJ7 | MME-216 | ENST00000615825 | 5523 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | MIR544A-201 | ENST00000384855 | 91 nt | BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
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| TMX3 | Q96JJ7 | PRKACB-218 | ENST00000610703 | 4240 nt | TSL 2 BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
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| TMX3 | Q96JJ7 | MTCO3P29-201 | ENST00000432119 | 779 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
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| TMX3 | Q96JJ7 | AL353752.1-201 | ENST00000454946 | 260 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
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| TMX3 | Q96JJ7 | SNORD59.2-201 | ENST00000516873 | 68 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
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| TMX3 | Q96JJ7 | AC004832.5-201 | ENST00000608677 | 401 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | AC069200.1-201 | ENST00000609511 | 323 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | Z84484.1-202 | ENST00000612718 | 60 nt | TSL 5 BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | AC084757.4-201 | ENST00000616350 | 526 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | AC087588.2-201 | ENST00000617667 | 426 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | AL138825.1-201 | ENST00000618587 | 192 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | AL162373.1-201 | ENST00000620433 | 407 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | SCARNA4-201 | ENST00000629045 | 128 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | AC111000.4-202 | ENST00000505646 | 2648 nt | TSL 2 BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | OR5V1-217 | ENST00000641768 | 2763 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | DDX6-206 | ENST00000534980 | 4538 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | MTND5P1-201 | ENST00000445440 | 1375 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | ANKAR-209 | ENST00000520309 | 4410 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | FNBP1L-203 | ENST00000370253 | 3889 nt | APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | ERBIN-204 | ENST00000380943 | 6410 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | IL23R-205 | ENST00000637002 | 2208 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | RNU4-9P-201 | ENST00000364951 | 139 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | Y_RNA.527-201 | ENST00000384573 | 102 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | MIR591-201 | ENST00000385290 | 95 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | SNORA12.2-201 | ENST00000391040 | 156 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | AL162411.1-201 | ENST00000413145 | 526 nt | TSL 2 BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |