Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRZ4

C9orf47, Uncharacterized protein C9orf47, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf47Q6ZRZ4 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
C9orf47Q6ZRZ4 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
C9orf47Q6ZRZ4 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.56□□□□□ -2
C9orf47Q6ZRZ4 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC2.56□□□□□ -2
C9orf47Q6ZRZ4 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
C9orf47Q6ZRZ4 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
C9orf47Q6ZRZ4 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
C9orf47Q6ZRZ4 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
C9orf47Q6ZRZ4 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC2.55□□□□□ -2
C9orf47Q6ZRZ4 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC2.55□□□□□ -2
C9orf47Q6ZRZ4 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
C9orf47Q6ZRZ4 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC2.55□□□□□ -2
C9orf47Q6ZRZ4 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
C9orf47Q6ZRZ4 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC2.55□□□□□ -2
C9orf47Q6ZRZ4 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC2.55□□□□□ -2
C9orf47Q6ZRZ4 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC2.55□□□□□ -2
C9orf47Q6ZRZ4 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC2.55□□□□□ -2
C9orf47Q6ZRZ4 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC2.55□□□□□ -2
C9orf47Q6ZRZ4 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
C9orf47Q6ZRZ4 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC2.55□□□□□ -2
C9orf47Q6ZRZ4 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC2.55□□□□□ -2
C9orf47Q6ZRZ4 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC2.55□□□□□ -2
C9orf47Q6ZRZ4 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC2.55□□□□□ -2
C9orf47Q6ZRZ4 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
C9orf47Q6ZRZ4 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
C9orf47Q6ZRZ4 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC2.55□□□□□ -2
C9orf47Q6ZRZ4 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
C9orf47Q6ZRZ4 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC2.55□□□□□ -2
C9orf47Q6ZRZ4 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC2.55□□□□□ -2
C9orf47Q6ZRZ4 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC2.55□□□□□ -2
C9orf47Q6ZRZ4 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC2.55□□□□□ -2
C9orf47Q6ZRZ4 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC2.55□□□□□ -2
C9orf47Q6ZRZ4 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC2.55□□□□□ -2
C9orf47Q6ZRZ4 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC2.55□□□□□ -2
C9orf47Q6ZRZ4 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC2.55□□□□□ -2
C9orf47Q6ZRZ4 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC2.55□□□□□ -2
C9orf47Q6ZRZ4 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC2.55□□□□□ -2
C9orf47Q6ZRZ4 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC2.55□□□□□ -2
C9orf47Q6ZRZ4 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC2.55□□□□□ -2
C9orf47Q6ZRZ4 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC2.55□□□□□ -2
C9orf47Q6ZRZ4 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC2.55□□□□□ -2
C9orf47Q6ZRZ4 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC2.55□□□□□ -2
C9orf47Q6ZRZ4 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
C9orf47Q6ZRZ4 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
C9orf47Q6ZRZ4 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
C9orf47Q6ZRZ4 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC2.55□□□□□ -2
C9orf47Q6ZRZ4 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
C9orf47Q6ZRZ4 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC2.55□□□□□ -2
C9orf47Q6ZRZ4 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC2.55□□□□□ -2
C9orf47Q6ZRZ4 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
C9orf47Q6ZRZ4 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
C9orf47Q6ZRZ4 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
C9orf47Q6ZRZ4 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
C9orf47Q6ZRZ4 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
C9orf47Q6ZRZ4 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
C9orf47Q6ZRZ4 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC2.54□□□□□ -2
C9orf47Q6ZRZ4 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
C9orf47Q6ZRZ4 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC2.54□□□□□ -2
C9orf47Q6ZRZ4 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC2.54□□□□□ -2
C9orf47Q6ZRZ4 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
C9orf47Q6ZRZ4 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
C9orf47Q6ZRZ4 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC2.54□□□□□ -2
C9orf47Q6ZRZ4 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
C9orf47Q6ZRZ4 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC2.54□□□□□ -2
C9orf47Q6ZRZ4 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC2.54□□□□□ -2
C9orf47Q6ZRZ4 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC2.54□□□□□ -2
C9orf47Q6ZRZ4 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC2.54□□□□□ -2
C9orf47Q6ZRZ4 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC2.54□□□□□ -2
C9orf47Q6ZRZ4 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC2.54□□□□□ -2
C9orf47Q6ZRZ4 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC2.54□□□□□ -2
C9orf47Q6ZRZ4 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC2.54□□□□□ -2
C9orf47Q6ZRZ4 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
C9orf47Q6ZRZ4 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.54□□□□□ -2
C9orf47Q6ZRZ4 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.54□□□□□ -2
C9orf47Q6ZRZ4 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC2.54□□□□□ -2
C9orf47Q6ZRZ4 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
C9orf47Q6ZRZ4 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC2.54□□□□□ -2
C9orf47Q6ZRZ4 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
C9orf47Q6ZRZ4 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC2.54□□□□□ -2
C9orf47Q6ZRZ4 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC2.54□□□□□ -2
C9orf47Q6ZRZ4 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC2.54□□□□□ -2
C9orf47Q6ZRZ4 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC2.54□□□□□ -2
C9orf47Q6ZRZ4 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC2.54□□□□□ -2
C9orf47Q6ZRZ4 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC2.54□□□□□ -2
C9orf47Q6ZRZ4 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC2.54□□□□□ -2
C9orf47Q6ZRZ4 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC2.54□□□□□ -2
C9orf47Q6ZRZ4 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC2.54□□□□□ -2
C9orf47Q6ZRZ4 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC2.54□□□□□ -2
C9orf47Q6ZRZ4 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC2.54□□□□□ -2
C9orf47Q6ZRZ4 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC2.54□□□□□ -2
C9orf47Q6ZRZ4 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC2.54□□□□□ -2
C9orf47Q6ZRZ4 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.54□□□□□ -2
C9orf47Q6ZRZ4 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
C9orf47Q6ZRZ4 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
C9orf47Q6ZRZ4 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
C9orf47Q6ZRZ4 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
C9orf47Q6ZRZ4 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
C9orf47Q6ZRZ4 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
C9orf47Q6ZRZ4 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
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