Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 ADAM3B-201ENST00000569937 840 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 USP9YP19-201ENST00000412165 485 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 HLA-S-202ENST00000425174 53 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 Z77249.1-201ENST00000444622 1175 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 AC012170.3-201ENST00000560159 297 ntTSL 2 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC-0.37□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 RNU4-23P-201ENST00000362839 140 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 ZNF93-209ENST00000638737 1020 ntTSL 5 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 LINC00434-201ENST00000423739 419 ntTSL 3 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 AC111000.5-201ENST00000506559 1178 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
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LAMA3Q16787 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 Y_RNA.566-201ENST00000384735 101 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
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LAMA3Q16787 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
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LAMA3Q16787 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
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LAMA3Q16787 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
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LAMA3Q16787 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC-0.39□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
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LAMA3Q16787 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
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