Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
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SGCBQ16585 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
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SGCBQ16585 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
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SGCBQ16585 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
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SGCBQ16585 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
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