Protein–RNA interactions for Protein: Q16540

MRPL23, 39S ribosomal protein L23, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL23Q16540 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
MRPL23Q16540 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
MRPL23Q16540 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
MRPL23Q16540 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
MRPL23Q16540 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
MRPL23Q16540 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
MRPL23Q16540 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
MRPL23Q16540 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
MRPL23Q16540 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
MRPL23Q16540 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
MRPL23Q16540 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
MRPL23Q16540 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
MRPL23Q16540 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
MRPL23Q16540 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
MRPL23Q16540 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
MRPL23Q16540 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
MRPL23Q16540 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
MRPL23Q16540 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
MRPL23Q16540 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
MRPL23Q16540 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
MRPL23Q16540 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
MRPL23Q16540 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
MRPL23Q16540 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC1.34□□□□□ -2.19
MRPL23Q16540 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
MRPL23Q16540 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
MRPL23Q16540 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
MRPL23Q16540 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
MRPL23Q16540 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
MRPL23Q16540 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
MRPL23Q16540 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC1.33□□□□□ -2.2
MRPL23Q16540 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MRPL23Q16540 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MRPL23Q16540 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MRPL23Q16540 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MRPL23Q16540 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MRPL23Q16540 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MRPL23Q16540 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MRPL23Q16540 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
MRPL23Q16540 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
MRPL23Q16540 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MRPL23Q16540 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MRPL23Q16540 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MRPL23Q16540 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MRPL23Q16540 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MRPL23Q16540 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MRPL23Q16540 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MRPL23Q16540 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MRPL23Q16540 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
MRPL23Q16540 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MRPL23Q16540 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MRPL23Q16540 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MRPL23Q16540 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MRPL23Q16540 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MRPL23Q16540 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
MRPL23Q16540 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MRPL23Q16540 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MRPL23Q16540 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MRPL23Q16540 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MRPL23Q16540 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
MRPL23Q16540 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
MRPL23Q16540 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
MRPL23Q16540 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
MRPL23Q16540 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
MRPL23Q16540 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
MRPL23Q16540 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
MRPL23Q16540 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
MRPL23Q16540 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
MRPL23Q16540 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
MRPL23Q16540 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
MRPL23Q16540 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
MRPL23Q16540 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
MRPL23Q16540 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
MRPL23Q16540 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
MRPL23Q16540 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
MRPL23Q16540 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
MRPL23Q16540 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
MRPL23Q16540 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
MRPL23Q16540 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
MRPL23Q16540 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
MRPL23Q16540 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
MRPL23Q16540 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
MRPL23Q16540 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
MRPL23Q16540 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
MRPL23Q16540 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
MRPL23Q16540 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
MRPL23Q16540 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
MRPL23Q16540 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
MRPL23Q16540 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
MRPL23Q16540 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
MRPL23Q16540 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
MRPL23Q16540 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
MRPL23Q16540 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
MRPL23Q16540 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
MRPL23Q16540 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
MRPL23Q16540 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
MRPL23Q16540 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
MRPL23Q16540 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
MRPL23Q16540 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
MRPL23Q16540 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
MRPL23Q16540 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.3 ms