Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC0.49□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 AL138955.1-201ENST00000622881 1040 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC0.48□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC0.48□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 AC007495.2-201ENST00000562822 459 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC0.47□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC0.47□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.47□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.46□□□□□ -2.34
SNCBQ16143 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SNCBQ16143 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SNCBQ16143 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SNCBQ16143 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SNCBQ16143 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SNCBQ16143 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SNCBQ16143 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
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SNCBQ16143 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SNCBQ16143 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SNCBQ16143 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SNCBQ16143 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SNCBQ16143 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SNCBQ16143 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SNCBQ16143 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SNCBQ16143 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SNCBQ16143 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC0.46□□□□□ -2.34
SNCBQ16143 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SNCBQ16143 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
SNCBQ16143 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SNCBQ16143 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
SNCBQ16143 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SNCBQ16143 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
SNCBQ16143 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SNCBQ16143 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SNCBQ16143 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SNCBQ16143 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SNCBQ16143 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SNCBQ16143 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SNCBQ16143 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SNCBQ16143 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SNCBQ16143 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SNCBQ16143 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SNCBQ16143 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SNCBQ16143 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.45□□□□□ -2.34
SNCBQ16143 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
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SNCBQ16143 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SNCBQ16143 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SNCBQ16143 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
SNCBQ16143 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC0.45□□□□□ -2.34
SNCBQ16143 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SNCBQ16143 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
SNCBQ16143 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC0.45□□□□□ -2.34
SNCBQ16143 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
SNCBQ16143 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SNCBQ16143 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SNCBQ16143 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SNCBQ16143 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SNCBQ16143 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SNCBQ16143 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SNCBQ16143 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SNCBQ16143 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SNCBQ16143 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
SNCBQ16143 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SNCBQ16143 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SNCBQ16143 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC0.44□□□□□ -2.34
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