Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CHRNA6Q15825 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CHRNA6Q15825 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
CHRNA6Q15825 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CHRNA6Q15825 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CHRNA6Q15825 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CHRNA6Q15825 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CHRNA6Q15825 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
CHRNA6Q15825 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
CHRNA6Q15825 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
CHRNA6Q15825 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CHRNA6Q15825 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CHRNA6Q15825 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
CHRNA6Q15825 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CHRNA6Q15825 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CHRNA6Q15825 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CHRNA6Q15825 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CHRNA6Q15825 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CHRNA6Q15825 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CHRNA6Q15825 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CHRNA6Q15825 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CHRNA6Q15825 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CHRNA6Q15825 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CHRNA6Q15825 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CHRNA6Q15825 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CHRNA6Q15825 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CHRNA6Q15825 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CHRNA6Q15825 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CHRNA6Q15825 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CHRNA6Q15825 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CHRNA6Q15825 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CHRNA6Q15825 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CHRNA6Q15825 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CHRNA6Q15825 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
CHRNA6Q15825 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CHRNA6Q15825 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CHRNA6Q15825 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CHRNA6Q15825 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CHRNA6Q15825 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CHRNA6Q15825 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CHRNA6Q15825 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CHRNA6Q15825 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
CHRNA6Q15825 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CHRNA6Q15825 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CHRNA6Q15825 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CHRNA6Q15825 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
CHRNA6Q15825 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CHRNA6Q15825 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CHRNA6Q15825 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CHRNA6Q15825 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CHRNA6Q15825 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
CHRNA6Q15825 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CHRNA6Q15825 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CHRNA6Q15825 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CHRNA6Q15825 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC1.47□□□□□ -2.17
CHRNA6Q15825 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CHRNA6Q15825 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CHRNA6Q15825 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CHRNA6Q15825 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CHRNA6Q15825 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CHRNA6Q15825 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
CHRNA6Q15825 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CHRNA6Q15825 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CHRNA6Q15825 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CHRNA6Q15825 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CHRNA6Q15825 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.46□□□□□ -2.18
CHRNA6Q15825 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CHRNA6Q15825 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CHRNA6Q15825 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CHRNA6Q15825 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CHRNA6Q15825 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
CHRNA6Q15825 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
CHRNA6Q15825 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CHRNA6Q15825 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CHRNA6Q15825 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CHRNA6Q15825 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CHRNA6Q15825 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CHRNA6Q15825 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CHRNA6Q15825 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CHRNA6Q15825 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CHRNA6Q15825 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CHRNA6Q15825 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
CHRNA6Q15825 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
CHRNA6Q15825 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CHRNA6Q15825 MIR4760-201ENST00000585040 80 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CHRNA6Q15825 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CHRNA6Q15825 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CHRNA6Q15825 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CHRNA6Q15825 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CHRNA6Q15825 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CHRNA6Q15825 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CHRNA6Q15825 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CHRNA6Q15825 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CHRNA6Q15825 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
CHRNA6Q15825 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
CHRNA6Q15825 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
CHRNA6Q15825 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CHRNA6Q15825 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CHRNA6Q15825 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CHRNA6Q15825 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.2 ms