Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 AC093875.1-201ENST00000623688 504 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AC116563.2-201ENST00000624751 535 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 LINC01967-201ENST00000356047 755 ntTSL 5 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC-0.2□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AC117525.1-201ENST00000515228 503 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 RNU4-23P-201ENST00000362839 140 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC-0.2□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 Y_RNA.566-201ENST00000384735 101 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 UBE2V1P15-201ENST00000407776 448 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC-0.2□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AC025423.2-201ENST00000537570 439 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 RNU4-27P-201ENST00000410889 139 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AC091212.1-201ENST00000474798 395 ntTSL 5 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 LINC01930-201ENST00000602672 870 ntTSL 5 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AC098592.2-201ENST00000413158 265 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 MTCO3P17-201ENST00000443775 513 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AC010460.2-201ENST00000509054 677 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 SCARNA20.2-201ENST00000516052 116 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AL109659.3-201ENST00000624985 950 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 RNA5SP163-201ENST00000410304 99 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 SPINK13-201ENST00000398450 509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.21□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 ZNF736P1Y-201ENST00000440402 1276 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 LINC01218-201ENST00000515150 481 ntTSL 3 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AL158050.2-201ENST00000605336 568 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
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