Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ALX1Q15699 SPINK13-201ENST00000398450 509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.2□□□□□ -2.38
ALX1Q15699 MTND4LP7-201ENST00000431728 294 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ALX1Q15699 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC0.2□□□□□ -2.38
ALX1Q15699 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ALX1Q15699 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ALX1Q15699 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ALX1Q15699 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ALX1Q15699 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ALX1Q15699 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ALX1Q15699 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ALX1Q15699 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ALX1Q15699 KATNBL1P5-201ENST00000605015 517 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ALX1Q15699 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ALX1Q15699 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC0.2□□□□□ -2.38
ALX1Q15699 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.2□□□□□ -2.38
ALX1Q15699 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ALX1Q15699 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ALX1Q15699 AL158050.1-201ENST00000416077 457 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ALX1Q15699 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ALX1Q15699 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ALX1Q15699 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ALX1Q15699 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ALX1Q15699 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ALX1Q15699 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ALX1Q15699 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC0.19□□□□□ -2.38
ALX1Q15699 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ALX1Q15699 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ALX1Q15699 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ALX1Q15699 AC004987.4-201ENST00000603383 338 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ALX1Q15699 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ALX1Q15699 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ALX1Q15699 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ALX1Q15699 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ALX1Q15699 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ALX1Q15699 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ALX1Q15699 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
ALX1Q15699 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ALX1Q15699 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.18□□□□□ -2.38
ALX1Q15699 LINC02258-201ENST00000551280 777 ntTSL 2 BASIC0.18□□□□□ -2.38
ALX1Q15699 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ALX1Q15699 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ALX1Q15699 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ALX1Q15699 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ALX1Q15699 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ALX1Q15699 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ALX1Q15699 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ALX1Q15699 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC0.17□□□□□ -2.38
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ALX1Q15699 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC0.17□□□□□ -2.38
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ALX1Q15699 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ALX1Q15699 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.16□□□□□ -2.38
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ALX1Q15699 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
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ALX1Q15699 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC0.16□□□□□ -2.38
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ALX1Q15699 MTCO3P43-201ENST00000440974 771 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ALX1Q15699 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ALX1Q15699 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ALX1Q15699 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ALX1Q15699 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
ALX1Q15699 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ALX1Q15699 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ALX1Q15699 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ALX1Q15699 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.15□□□□□ -2.39
ALX1Q15699 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ALX1Q15699 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ALX1Q15699 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ALX1Q15699 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ALX1Q15699 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ALX1Q15699 RNU4-27P-201ENST00000410889 139 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ALX1Q15699 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC0.15□□□□□ -2.39
ALX1Q15699 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC0.15□□□□□ -2.39
ALX1Q15699 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC0.15□□□□□ -2.39
ALX1Q15699 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC0.15□□□□□ -2.39
ALX1Q15699 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ALX1Q15699 MIR16-2-201ENST00000362117 81 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ALX1Q15699 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ALX1Q15699 SNORA63.3-201ENST00000362682 132 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ALX1Q15699 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ALX1Q15699 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ALX1Q15699 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
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