Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIP4Q15650 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIP4Q15650 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIP4Q15650 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIP4Q15650 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIP4Q15650 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIP4Q15650 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIP4Q15650 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIP4Q15650 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIP4Q15650 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIP4Q15650 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIP4Q15650 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIP4Q15650 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIP4Q15650 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIP4Q15650 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIP4Q15650 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.74
TRIP4Q15650 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
TRIP4Q15650 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
TRIP4Q15650 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 AC025554.1-201ENST00000505641 188 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 PTAR1-202ENST00000377200 9876 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 ETV1-202ENST00000399357 6096 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.5 ms