Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC3.1□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
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PTPRRQ15256 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
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PTPRRQ15256 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.92
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PTPRRQ15256 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPRRQ15256 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPRRQ15256 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
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PTPRRQ15256 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPRRQ15256 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPRRQ15256 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPRRQ15256 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
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