Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NECTIN1Q15223 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC2.32□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC2.32□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
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NECTIN1Q15223 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
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NECTIN1Q15223 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NECTIN1Q15223 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
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