Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.05□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 AC114878.1-201ENST00000441166 358 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 LINC02066-201ENST00000492731 580 ntTSL 4 BASIC0.05□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC0.05□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC0.04□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC0.04□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC0.04□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC0.04□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC0.04□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.03□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC0.03□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 AL353718.1-201ENST00000451028 517 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SMCO1Q147U7 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SMCO1Q147U7 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.02□□□□□ -2.41
SMCO1Q147U7 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SMCO1Q147U7 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SMCO1Q147U7 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC0.02□□□□□ -2.41
SMCO1Q147U7 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SMCO1Q147U7 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
SMCO1Q147U7 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC0.02□□□□□ -2.41
SMCO1Q147U7 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SMCO1Q147U7 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
SMCO1Q147U7 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
SMCO1Q147U7 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC0.02□□□□□ -2.41
SMCO1Q147U7 LINC02258-201ENST00000551280 777 ntTSL 2 BASIC0.02□□□□□ -2.41
SMCO1Q147U7 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC0.02□□□□□ -2.41
SMCO1Q147U7 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SMCO1Q147U7 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SMCO1Q147U7 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC0.02□□□□□ -2.41
SMCO1Q147U7 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SMCO1Q147U7 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SMCO1Q147U7 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SMCO1Q147U7 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SMCO1Q147U7 RPL22P18-201ENST00000417197 377 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SMCO1Q147U7 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SMCO1Q147U7 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SMCO1Q147U7 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC0.01□□□□□ -2.41
SMCO1Q147U7 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SMCO1Q147U7 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SMCO1Q147U7 RNU6-467P-201ENST00000517027 110 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SMCO1Q147U7 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC0.01□□□□□ -2.41
SMCO1Q147U7 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC0.01□□□□□ -2.41
SMCO1Q147U7 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SMCO1Q147U7 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SMCO1Q147U7 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SMCO1Q147U7 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SMCO1Q147U7 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SMCO1Q147U7 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SMCO1Q147U7 SPINK13-201ENST00000398450 509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0□□□□□ -2.41
SMCO1Q147U7 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC0□□□□□ -2.41
SMCO1Q147U7 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SMCO1Q147U7 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC0□□□□□ -2.41
SMCO1Q147U7 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC0□□□□□ -2.41
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