Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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SEMA3AQ14563 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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SEMA3AQ14563 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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SEMA3AQ14563 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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SEMA3AQ14563 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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SEMA3AQ14563 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
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SEMA3AQ14563 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
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