Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.1□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 BNIP3P40-201ENST00000596017 556 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 MTND4P9-201ENST00000507819 1346 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 MTND3P3-201ENST00000505004 126 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 AC099063.1-201ENST00000437128 324 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.7 ms