Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CUL1Q13616 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CUL1Q13616 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CUL1Q13616 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CUL1Q13616 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CUL1Q13616 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CUL1Q13616 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CUL1Q13616 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CUL1Q13616 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CUL1Q13616 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CUL1Q13616 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CUL1Q13616 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CUL1Q13616 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CUL1Q13616 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CUL1Q13616 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CUL1Q13616 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CUL1Q13616 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CUL1Q13616 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CUL1Q13616 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CUL1Q13616 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CUL1Q13616 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CUL1Q13616 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CUL1Q13616 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CUL1Q13616 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CUL1Q13616 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CUL1Q13616 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CUL1Q13616 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CUL1Q13616 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CUL1Q13616 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
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