Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NEUROD1Q13562 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
NEUROD1Q13562 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NEUROD1Q13562 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.8 ms