Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PRPF4BQ13523 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
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