Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 AL158050.2-201ENST00000605336 568 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC1.02□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC1.02□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 AC027544.2-201ENST00000539313 630 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 AL049777.1-201ENST00000622740 518 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 snoU109.3-201ENST00000459477 145 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC1.01□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC1□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC1□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC1□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 RNU6-1176P-201ENST00000390955 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC1□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC1□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC1□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC1□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC1□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 AC018645.2-201ENST00000609151 472 ntBASIC1□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC1□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 AL009048.1-201ENST00000450437 298 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC0.99□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 AC020891.3-201ENST00000560011 363 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
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