Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
AP3B2Q13367 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
AP3B2Q13367 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
AP3B2Q13367 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
AP3B2Q13367 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
AP3B2Q13367 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
AP3B2Q13367 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
AP3B2Q13367 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
AP3B2Q13367 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
AP3B2Q13367 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
AP3B2Q13367 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
AP3B2Q13367 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
AP3B2Q13367 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
AP3B2Q13367 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
AP3B2Q13367 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
AP3B2Q13367 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
AP3B2Q13367 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
AP3B2Q13367 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
AP3B2Q13367 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
AP3B2Q13367 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
AP3B2Q13367 PTAR1-202ENST00000377200 9876 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
AP3B2Q13367 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
AP3B2Q13367 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
AP3B2Q13367 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
AP3B2Q13367 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
AP3B2Q13367 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
AP3B2Q13367 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
AP3B2Q13367 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
AP3B2Q13367 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
AP3B2Q13367 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
AP3B2Q13367 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
AP3B2Q13367 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
AP3B2Q13367 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
AP3B2Q13367 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
AP3B2Q13367 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
AP3B2Q13367 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
AP3B2Q13367 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
AP3B2Q13367 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
AP3B2Q13367 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
AP3B2Q13367 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
AP3B2Q13367 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
AP3B2Q13367 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
AP3B2Q13367 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC4.08□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC4.07□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95 ms