Protein–RNA interactions for Protein: Q13136

PPFIA1, Liprin-alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA1Q13136 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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