Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
DUSP4Q13115 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
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