Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRAF1Q13077 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.5 ms