Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXF2Q12947 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
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