Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CENPEQ02224 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CENPEQ02224 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CENPEQ02224 TAF9BP2-201ENST00000400856 499 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CENPEQ02224 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CENPEQ02224 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CENPEQ02224 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC-0.71□□□□□ -2.52
CENPEQ02224 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC-0.71□□□□□ -2.52
CENPEQ02224 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CENPEQ02224 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC-0.71□□□□□ -2.52
CENPEQ02224 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CENPEQ02224 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CENPEQ02224 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC-0.71□□□□□ -2.52
CENPEQ02224 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CENPEQ02224 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CENPEQ02224 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CENPEQ02224 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC-0.72□□□□□ -2.52
CENPEQ02224 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CENPEQ02224 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CENPEQ02224 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CENPEQ02224 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CENPEQ02224 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CENPEQ02224 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CENPEQ02224 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC-0.72□□□□□ -2.52
CENPEQ02224 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CENPEQ02224 RPL7P55-201ENST00000450522 746 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CENPEQ02224 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC-0.72□□□□□ -2.52
CENPEQ02224 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CENPEQ02224 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC-0.72□□□□□ -2.52
CENPEQ02224 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC-0.72□□□□□ -2.52
CENPEQ02224 MIR4770-201ENST00000579149 58 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CENPEQ02224 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CENPEQ02224 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CENPEQ02224 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CENPEQ02224 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 AC108157.1-201ENST00000510511 539 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 AC079917.1-202ENST00000534059 625 ntTSL 3 BASIC-0.73□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC-0.73□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC-0.73□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.73□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 RNY4-201ENST00000516507 96 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 AC104689.1-201ENST00000473356 768 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.74□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC-0.74□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC-0.74□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC-0.74□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 AF129408.1-201ENST00000608767 431 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC-0.75□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC-0.75□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109 ms