Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 ARHGEF9-229ENST00000637040 5001 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 ERG-202ENST00000398897 4651 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 CCDC186-203ENST00000369287 7245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 PARD3B-213ENST00000614500 7538 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 SNORA70H-201ENST00000383910 135 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 SNORA70J-201ENST00000384182 135 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 AC120057.5-201ENST00000623840 154 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 ZNF528-201ENST00000360465 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 UPF2-201ENST00000356352 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 N4BP2-201ENST00000261435 9744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 LYSMD3-201ENST00000315948 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 LNPK-212ENST00000544803 7647 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 NBPF12-205ENST00000617614 4630 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 WDR72-208ENST00000614174 4224 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 MDM4-216ENST00000616250 9597 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 OR7D4-202ENST00000641244 4968 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 OR7D4-203ENST00000641669 4965 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 LCP2-201ENST00000046794 4678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 OR7C1-205ENST00000642030 11778 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 SCARB2-207ENST00000638295 4507 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 RAB30-214ENST00000534141 3746 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 MPHOSPH9-220ENST00000606320 6351 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 AC005674.2-201ENST00000561486 3510 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 SOAT1-201ENST00000367619 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 ZCCHC6-206ENST00000375963 5379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 ZNF525-201ENST00000467003 6107 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 GALNT5-201ENST00000259056 6171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
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