Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC0.34□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 GXYLT1P1-201ENST00000446657 490 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 AC108729.2-201ENST00000476543 840 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC0.34□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC0.34□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC0.34□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC0.34□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 AC100814.1-201ENST00000606963 623 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 RNU6-883P-201ENST00000384597 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 RNU6-1176P-201ENST00000390955 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 CLYBL-AS1-201ENST00000416009 621 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC0.33□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC0.33□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC0.33□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC0.33□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 RPL21P136-201ENST00000605378 396 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 AC099654.9-201ENST00000637055 678 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 RNU6-481P-201ENST00000384194 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 RSL24D1P8-201ENST00000434442 492 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 AL158050.1-201ENST00000416077 457 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 AL121904.1-202ENST00000416638 656 ntTSL 5 BASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 RPL7P55-201ENST00000450522 746 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 SNRPGP1-201ENST00000553864 222 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 AC114878.1-201ENST00000441166 358 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 AC079917.1-202ENST00000534059 625 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.6 ms