Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 SUMO2P5-201ENST00000506790 245 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 AC005774.1-201ENST00000565247 567 ntTSL 4 BASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 AC092574.1-201ENST00000609771 420 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 HTN3-205ENST00000530128 775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 AC079917.1-202ENST00000534059 625 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 LINC00446-202ENST00000438327 357 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 RNU6-334P-201ENST00000517072 102 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 VN1R87P-201ENST00000596706 487 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
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