Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC2.65□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC2.65□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.9 ms