Protein–RNA interactions for Protein: Q99633

PRPF18, Pre-mRNA-splicing factor 18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF18Q99633 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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PRPF18Q99633 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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PRPF18Q99633 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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PRPF18Q99633 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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PRPF18Q99633 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
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PRPF18Q99633 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PRPF18Q99633 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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PRPF18Q99633 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
PRPF18Q99633 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.96
PRPF18Q99633 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PRPF18Q99633 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PRPF18Q99633 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PRPF18Q99633 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PRPF18Q99633 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PRPF18Q99633 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PRPF18Q99633 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PRPF18Q99633 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PRPF18Q99633 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PRPF18Q99633 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PRPF18Q99633 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PRPF18Q99633 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PRPF18Q99633 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PRPF18Q99633 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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