Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 RNU4-23P-201ENST00000362839 140 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC-0.53□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 AL358972.1-201ENST00000434356 466 ntTSL 2 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 AC000111.1-201ENST00000441019 221 ntTSL 3 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 AC004865.1-201ENST00000442276 1003 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.53□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 AL359238.1-201ENST00000557770 744 ntTSL 3 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 AC004160.1-210ENST00000599875 689 ntTSL 5 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.53□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 MIR196A1-201ENST00000388006 70 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 DIAPH3-AS1-203ENST00000435636 467 ntTSL 2 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 MIR3115-201ENST00000577915 68 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 BNIP3P27-201ENST00000599991 412 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 LINC02098-201ENST00000608492 475 ntTSL 3 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 ZNF736P1Y-201ENST00000440402 1276 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 Z77249.1-201ENST00000444622 1175 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 AC104689.1-201ENST00000473356 768 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 AC117525.1-201ENST00000515228 503 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 AC079917.1-202ENST00000534059 625 ntTSL 3 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 AC112220.2-201ENST00000605513 533 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 AC004241.3-201ENST00000611728 517 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 MIR1246-201ENST00000636535 73 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC-0.56□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 ADAM3B-201ENST00000569937 840 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
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