Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
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ZBED3Q96IU2 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
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ZBED3Q96IU2 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.45□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
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ZBED3Q96IU2 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
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ZBED3Q96IU2 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC1.44□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC1.44□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
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