Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CHCHD4Q8N4Q1 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CHCHD4Q8N4Q1 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CHCHD4Q8N4Q1 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CHCHD4Q8N4Q1 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CHCHD4Q8N4Q1 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CHCHD4Q8N4Q1 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CHCHD4Q8N4Q1 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CHCHD4Q8N4Q1 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CHCHD4Q8N4Q1 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CHCHD4Q8N4Q1 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CHCHD4Q8N4Q1 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CHCHD4Q8N4Q1 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
CHCHD4Q8N4Q1 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CHCHD4Q8N4Q1 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CHCHD4Q8N4Q1 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CHCHD4Q8N4Q1 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CHCHD4Q8N4Q1 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CHCHD4Q8N4Q1 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CHCHD4Q8N4Q1 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CHCHD4Q8N4Q1 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CHCHD4Q8N4Q1 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CHCHD4Q8N4Q1 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CHCHD4Q8N4Q1 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CHCHD4Q8N4Q1 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CHCHD4Q8N4Q1 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CHCHD4Q8N4Q1 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CHCHD4Q8N4Q1 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CHCHD4Q8N4Q1 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CHCHD4Q8N4Q1 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CHCHD4Q8N4Q1 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CHCHD4Q8N4Q1 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CHCHD4Q8N4Q1 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
CHCHD4Q8N4Q1 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CHCHD4Q8N4Q1 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CHCHD4Q8N4Q1 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CHCHD4Q8N4Q1 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CHCHD4Q8N4Q1 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CHCHD4Q8N4Q1 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CHCHD4Q8N4Q1 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CHCHD4Q8N4Q1 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CHCHD4Q8N4Q1 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CHCHD4Q8N4Q1 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CHCHD4Q8N4Q1 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CHCHD4Q8N4Q1 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CHCHD4Q8N4Q1 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
CHCHD4Q8N4Q1 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CHCHD4Q8N4Q1 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CHCHD4Q8N4Q1 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CHCHD4Q8N4Q1 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CHCHD4Q8N4Q1 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CHCHD4Q8N4Q1 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CHCHD4Q8N4Q1 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CHCHD4Q8N4Q1 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CHCHD4Q8N4Q1 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CHCHD4Q8N4Q1 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CHCHD4Q8N4Q1 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CHCHD4Q8N4Q1 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CHCHD4Q8N4Q1 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CHCHD4Q8N4Q1 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CHCHD4Q8N4Q1 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CHCHD4Q8N4Q1 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CHCHD4Q8N4Q1 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CHCHD4Q8N4Q1 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CHCHD4Q8N4Q1 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CHCHD4Q8N4Q1 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CHCHD4Q8N4Q1 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CHCHD4Q8N4Q1 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CHCHD4Q8N4Q1 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CHCHD4Q8N4Q1 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CHCHD4Q8N4Q1 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CHCHD4Q8N4Q1 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CHCHD4Q8N4Q1 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CHCHD4Q8N4Q1 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CHCHD4Q8N4Q1 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CHCHD4Q8N4Q1 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CHCHD4Q8N4Q1 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CHCHD4Q8N4Q1 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.2 ms