Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
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