Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 HNRNPDP2-201ENST00000406475 478 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC-0.35□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 AC087071.2-201ENST00000483283 575 ntTSL 4 BASIC-0.35□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC-0.35□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC-0.35□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC-0.35□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC-0.35□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 Y_RNA.232-201ENST00000364369 96 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 MTCO3P43-201ENST00000440974 771 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 AC134980.1-208ENST00000640228 535 ntTSL 5 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 AC025423.2-201ENST00000537570 439 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 AC108721.1-201ENST00000547088 348 ntTSL 3 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 RPL7P55-201ENST00000450522 746 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 AL357094.1-201ENST00000603845 844 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC-0.37□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 MIR196A1-201ENST00000388006 70 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 RPL22P22-201ENST00000395439 379 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 MTND4LP21-201ENST00000415303 295 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
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