Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
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