Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC3.71□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC3.68□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
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