Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

Predictions only

Length 942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 PCDH15-234ENST00000622048 6820 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 PTAR1-202ENST00000377200 9876 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
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