Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
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CNGA3Q16281 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
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CNGA3Q16281 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
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